El modo principal de némesis: Aftermath es el modo epílogo, un juego corto (45-60 min.) 5 turno, que se juega después de un juego regular. Al comienzo de este epílogo, ha pasado una cantidad de tiempo no especificada desde los eventos que ocurrieron en el juego de la base de némesis. Los jugadores usan personajes (que no han participado en el juego base) que ingresan al némesis para investigar. El barco tiene muchas cicatrices de sus tribulaciones pasadas, por lo que cualquier sobra de su juego anterior tendrá efectos en su juego de epílogo.

Un juego de epílogo es mucho más corto que un juego de némesis normal, pero es más difícil y ofrece un juego muy dinámico. En lugar de objetivos, los jugadores tienen que lidiar con requisitos personales aparentemente simples, mientras intentan cooperar para hacer frente a varias alertas. Además, los jugadores que buscan más intereses egoístas podrían aceptar la oferta lucrativa